Estructura
La forma de les proteïnes, essencial per a la seva funció biològica, es pot analitzar en quatre nivells:
· Estructura primària: seqüència (ordre en la cadena) dels seus aminoàcids. - El nombre possible de combinacions de vint aminoàcids, repetits o no, és il·limitat. - Hi ha bancs de dades accessibles a Internet de totes les estructures primàries conegudes. · Conformació: la forma tridimensional - La cadena d’aminoàcids es plega sobre ella mateixa i adopta una forma o conformació de mínima energia ( amagant les cadenes laterals hidrofòbiques a l’interior, exposant les cadenes hidrofíliques, establint enllaços entre zones de la mateixa cadena (disulfur, d’hidrogen, de Van der Waals, iònics, etc.)). Forma les estructures secundària i terciària. - Estructura secundària: patrons locals de plegament · Si es comparen les conformacions de moltes proteïnes, es veu que hi ha uns patrons de plegament, que són comuns a moltes cadenes. · Els més generals són l’ hèlix a i la làmina b , o full plegat. - Estructura terciària: plegament general · És característic de cada proteïna. · Hi ha proteïnes fibroses (conformació allargada) i globulars (conformació arrodonida). - Estructura quaternària: associació de proteïnes · Iguals o diferents entre si. · Per enllaços no covalents. |
Activitats biològiques
Les proteïnes presenten una gran variabilitat d’estructures i d’activitats biològiques: enzims (faciliten les reaccions bioquímiques), components estructurals (citosquelet, cilis i flagels), components intercel·lulars (el col·lagen als teixits connectius), hormones, receptors, transportadors (de membrana pel citosol, de ferro per la sang, oxigen), anticossos, components contràctils (actina i miosina), factors de coagulació, etc.
L’activitat de les proteïnes depèn de la seva conformació, ja que permet o no l’encaix perfecte imprescindible amb les molècules amb les quals interaccionen (o lligands: substrats, antígens, ions, etc.): - Desnaturalització: pèrdua del plegament d’una proteïna, mitjançant algun tractament químic (calor, pH, dissolvents). Comporta la pèrdua de l seva activitat biològica. - Renaturalització: recuperació de la conformació original (nativa) i de la activitat biològica. Només és possible en alguns casos i condicions. |